Действие второго сезона разворачиваются спустя 6 месяцев после событий произошедших в «башне». По всей Америке ходят истории о том, как все еще работающая техника чудесным образом включалась ровно на 10 минут, а потом все снова потухло. Семья Мэттисон находит приют в Техасе, в родном городке Рэйчел Мэтисон, где все еще жил и работал врачом ее отец. Отец и сын Нэвилл находятся на восточном побережье, в постоянных поисках Джулии Нэвилл, где и встречаются с новой властью.

В Техас пришли бандиты с севера, и над городком нависла смертельная опасность. В результате первого нападения бандиты похитили шерифа и Майлса Мэтисона, а также смертельно ранили Аарона Питтмана, последний к всеобщему удивлению выживает после двух часов клинической смерти.

Правительство США постепенно устанавливает свою власть даже в удаленных городах. Они умны, хорошо вооружены и хорошо заплатят тем, кто приведет им живых Монро и Мэттисона.

Рейчел вызывает подозрения, когда пытается найти патриотов среди правителей Уиллоубай.

Аарон и Рейчел раздумывают над экстремальным воздействием нано-технологий. Тем временем возвращается человек из прошлого Майлса.

Монро оказывается лицом к лицу со смертной казнью, а Майлс обдумывает последствия его действий. Чарли, Рейчел и Джин расспрашивают Монро о его истинной преданности, поскольку он может быть их единственным союзником в борьбе против патриотов. Тем временем, у Аарона продолжаются видения, которые приводят к бесконечным вопросам.

Майлс и компания попали в ловушку в Уиллоубае. Когда Рейчел обнаружила некоторые тревожные факты, Майлс сделал то, что было лучше всего, чтобы преодолеть все препятствия, вставшие перед ним и теми, о ком он заботится. Тем временем, Чарли проводит время с мамой, пока между Невиллом и Джейсоном сохраняется напряжение.

Клиническая смерть Аарона привлекает внимание людей. Пока Майлс и его люди пытаются избежать опасности, в отношениях Рейчел и Джином сохраняется напряжение, которое оказывает воздействие на Чарли.

Невилл и Джейсон бегур в знакомое место. Отношения между Рейчел и Джином по-прежнему натянутые. У Аарона продолжаются странные видения.

Невилл и Джулия занимают новый участок, пока Аарон ищет наниты в Спринг Сити. Монро, Майлс и Рейчел едут в Мехико, чтобы найти сына Монро.

Монро оказывается на незнакомой территории, а Невилл и Джулия продолжают плясать под дудку Джейсона и его тревог. Тем временем, Джин подводит Чарли к непростому открытию.

Рейчел и Чарли с неохотой помогают Джину, когда он решает содействовать жителям Уиллоубай. Тем временем, Майлс и Монро продолжают собирать силы, чтобы выжить.

Пока Монро ведет Коннора и Чарли на опасное задание, Майлс и Рейчел присматривают за Уиллоубай. Тем временем, Аарон и Присцилла объединяются со старым другом, и у Невилла появляется новое поручение.

Дойл добирается до Уиллоубай. Питер угрожает Аарону и Присцилле. Монро и Коннор готовы драться до смерти.

В сериале вновь появляются знакомые лица, когда Аарон просыпается в мире, в котором снова есть электроэнергия.

Майлс, Чарли и Коннор, обнаруживают, что в Уиллоубай теперь есть центр перевоспитания. Рейчел и Майлс не могут договориться о том, как победить патриотов. Нэвилл и Джейсон обретают союзника.

Пока Джин и Майл отправляются в Уиллоубай в поисках союзников, Монро ухватывается за возможность ошарашить патриотов. Тем временем, политические маневры Невилла приводят его и Джейсона к серьезной опасности.

Джейсон возвращается к Майлсу с важнейшей информацией о дальнейших шагах патриотов в отношении Техаса. Подозрения Аарона по поводу все более странного поведения Присциллы растут.

Когда Невилл узнает о своем сыне, он заставляет Чарли рассказать ему, что произошло.

Уполномоченный властью новоприбывшего Президента, Труман пускает горчичный газ, чтобы убить Майлса и Монро. К огорчению Рейчел, Майлс соглашается присоединиться к Монро в безжалостном плане разгрома патриотов в их собственной игре.

Объединенные в стремлении победить патриотов, Невилл и Монро образуют ненадежный альянс. В поисках Аарона, Рейчел сталкивается лицом к лицу с наноботами. Для Майлса, Чарли и Джина события развиваются не по плану, когда они пытаются перехватить поставку горчичного газа у патриотов.

Ставки возрастают. Патриоты готовятся к войне. Майлз, Чарли и Монро готовят атаку на Патриотов, но им приходится импровизировать в рамках рискованного плана, чтобы остановить надвигающуюся войну между Калифорнией и Техасом.